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研究概要

当チームでは、理化学研究所オリジナルな画像処理技術の開発、多次元の計測技術の開発により、科学技術に貢献することを目的とします。特に、新規の情報処理技術、画像処理技術の研究開発により、理化学研究所内外の研究者に向けた、生命現象を定量化する新規ツールを確立することにより、数理生物学、バイオメディカルシミュレーション、医療診断・治療技術の向上に貢献します。

研究分野

工学、情報学、コンピューター科学

キーワード

多次元画像処理、多次元イメージング、バイオエンジニアリング、画像解析、医用工学

研究テーマ

1. 画像情報処理に関するアルゴリズム研究
2. 画像情報処理システムの開発
3. 生物情報データ作成のための計測システムの構築

主要論文

1. Sasaki, S., Mori, T., Enomoto, H., Nakamura, S., Yokota, H., Yamashita, H., Goto-Inoue, N., “Assessing Molecular Localization of Symbiont Microalgae in Coral Branches Through Mass Spectrometry Imaging”, Mar Biotechnol (2024).
2. Wang, J., Maeda, E., Tsujimura, Y., Abe, T., Kiyonari, H., Kitaguchi, T., Yokota, H., Matsumoto, T., “In situ FRET measurement of cellular tension using conventional confocal laser microscopy in newly established reporter mice expressing actinin tension sensor”, Scientific Reports. 13, Article number, 22729 (2023).
3. Takemoto, S., Hori, K., Yoshimasa, S., Nishimura, M., Nakajo, K., Inaba, A., Sasabe, M., Aoyama, N., Watanabe, T., Minakata, T., Ikematsu, H., Yokota, H., Yano, T.: “Computer-aided demarcation of early gastric cancer: a pilot comparative study with ndoscopists” , Journal of Gastroenterology (2023).
4. Umebayashi, M., Takemoto, S., Reymond, L., Sundukova, M., Hovius, R., Bucci, A., Heppenstall, P.A., Yokota, H., Johnsson, K., Riezman, H.: “A covalently-linked probe to monitor local membrane properties surrounding plasma membrane proteins” , Journal of Cell Biology, 222(3):e202206119 (2023).
5. Mitsui, T., Mori, A., Takamatsu, T., Kadota, T., Sato, K., Fukushima, R, Okubo, K., Umezawa, M., Takemura, H., Yokota, H., Kuwata, T., Kinoshita, T., Ikematsu, H., Yano, T., Maeda, S., Soga, K., “Evaluating the identification of the extent of gastric cancer by over-1000 nm near-infrared hyperspectral imaging using surgical specimens”, Journal of Biomedical Optics. Vol. 28. Issue 8, 086001 (2023).

主要メンバー